SwiftPharma药物发现平台

研发团队介绍

研发团队介绍

本次参赛的“智为药物”平台由蒋昌俊院士和高绍荣院士带领的同济大学科学智能团队研发,团队隶属于同济大学AI4S交叉研究小组。小组成员由同济大学计算机科学与技术学院、生命科学与技术学院、教育部细胞干性与命运编辑前沿科学中心以及化学科学与工程学院的教师和学生组成。团队致力于将人工智能技术与药学、化学、生物学深度融合,变革传统药物研发模式,加速创新药物的发现和开发进程。

研发团队

张旭东

张旭东

同济大学计算机科学与技术学院

east@tongji.edu.cn

计算机科学与技术博士生,研究兴趣为人工智能辅助药物设计,主要包括基于结构的药物设计、分子表征学习、分子性质预测等。

唐若蕙

唐若蕙

同济大学国豪书院

2350066@tongji.edu.cn

生物技术(强基)本科三年级,研究兴趣为药物设计与优化,主要包括药物结构优化、药物活性预测等。

赵文镐

赵文镐

同济大学上海自主智能无人系统科学中心

wenhao@tongji.edu.cn

智能技术与方法博士生,主要研究方向为水凝胶的智能制备与应用,包括选择合适的凝胶体系和导电材料,调控凝胶机械性能和电性能。

刘雪婷

刘雪婷

同济大学化学科学与工程学院

2110183@tongji.edu.cn

化学(医用高分子材料)博士,主要研究方向为生物高分子微纳米凝胶的可控合成,包括纳米载体设计及肿瘤治疗等。

石丽华

石丽华

同济大学电子与信息工程学院

lihua@tongji.edu.cn

电子信息博士生,研究兴趣主要为药物分子性质预测、药物分子逆合成路径设计。

王致远

王致远

同济大学计算机科学与技术学院

wangzhiyuan1@tongji.edu.cn

计算机科学与技术本科三年级,研究兴趣为基于表型的药物发现以及分子性质预测。

指导专家团队

陈广教授

陈广 教授

同济大学计算机科学与技术学院

guangchen@tongji.edu.cn

慕尼黑工业大学自然科学博士,同济大学长聘教授(青百A岗)、特聘研究员(青年百人人才计划A岗、B岗)、博士生导师、同济大学科研管理部副部长(青干计划)、同济大学通用具身智能实验室主任。入选国家高层次青年拔尖人才计划、国家重点研发计划首席科学家、上海市东方英才(上海市青年拔尖人才)、上海市青年科技启明星、上海科技青年35人引领计划、首批小米青年学者。当前主要研究兴趣为通用具身智能、药物发现、生物信息、神经科学等。

研究方向

通用具身智能 AI药物设计 生成模型 迁移学习
瞿三清

瞿三清 助理教授

同济大学计算机科学与技术学院

sanqingqu@tongji.edu.cn

同济大学工学博士,博后期间合作导师为中国工程院院士蒋昌俊。主要研究方向为机器学习、迁移学习及其在自然科学中的应用,重点关注神经网络模型对分布外数据的鲁棒性、泛化性与适应性。近五年以第一作者身份在IEEE TPAMI、IJCV、CVPR等人工智能领域顶级期刊与会议上发表论文10篇。近年来致力于将机器学习方法应用于药物发现,相关成果在2024年第二届全球AI药物研发算法大赛中荣获一等奖,并主持中国博士后科学基金面上项目《面向靶向药物的人工智能辅助分子设计方法研究》。

研究方向

机器学习 迁移学习 AI药物设计
张艳平

张艳平 副教授

生命科学与技术学院

yanpingzhang@tongji.edu.cn

同济大学生命科学与技术学院,副教授,博士生导师。本科及硕士就读于中南大学计算机科学与技术专业,博士就读于德国慕尼黑工业大学生物信息学专业,2017年获得博士学位。2018年受聘于同济大学生命科学与技术学院,主持多个国家级科研项目,包括国家自然科学青年基金、面上项目等,相关研究成果发表在Cell Stem Cell、Cell Research、Stem Cell Reports等权威学术期刊。

研究方向

人工智能辅助药物发现 靶点发现 单细胞转录组学

研究成果

学术论文

  • SWITCH: A deep generative model for spatial multi-omics integration and cross-modal prediction
    Zhongzhan Li, Sanqing Qu, Haixin Liang, Ruohui Tang, Xudong Zhang, Fan Lu, Jiani Yang, Ziling Gan, Shaorong Gao, Yanping Zhang, and Guang Chen
    Nature Computational Science, 2025
  • Nanogels confined superactive LOx-CPO for TME-responsive enzyme-gene therapy
    Xueting Liu, Dingze Zhou, Yuxi Zhang, Zonghui Zhao, Wenhao Zhao, Xia Wang, Qigang Wang
    Nano Today, 2025
  • GLC++: Source-Free Universal Domain Adaptation through Global-Local Clustering and Contrastive Affinity Learning
    Sanqing Qu, Tianpei Zou, Florian Röhrbein, Cewu Lu, Guang Chen, Dacheng Tao, Changjun Jiang
    IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence (T-PAMI), 2025
  • Deep reinforcement learning as an interaction agent to steer fragment-based 3D molecular generation for protein pockets
    Xudong Zhang, Jing Hou, Sanqing Qu, Fan Lu, Zhixin Tian, Alois Knoll, Guang Chen, Shaorong Gao, Yanping Zhang
    Briefings in Bioinformatics, 2025
  • General Class-Balanced Multicentric Dynamic Prototype Pseudo-Labeling for Source-Free Domain Adaptation
    Sanqing Qu, Guang Chen, Jing Zhang, Zhijun Li, Wei He, Dacheng Tao
    International Journal of Computer Vision (IJCV), 2025
  • Hgl: Hierarchical geometry learning for test-time adaptation in 3d point cloud segmentation
    Tianpei Zou, Sanqing Qu, Zhijun Li, Alois Knoll, Lianghua He, Guang Chen & Changjun Jiang
    European Conference on Computer Vision (ECCV Oral), 2024
  • Lead: Learning decomposition for source-free universal domain adaptation
    Sanqing Qu, Tianpei Zou, Lianghua He, Florian Röhrbein, Alois Knoll, Guang Chen, Changjun Jiang
    Proceedings of the IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), 2024
  • Map: Mask-pruning for source-free model intellectual property protection
    Boyang Peng, Sanqing Qu, Yong Wu, Tianpei Zou, Lianghua He, Alois Knoll, Guang Chen, Changjun Jiang
    Proceedings of the IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), 2024
  • Modality-agnostic debiasing for single domain generalization
    Sanqing Qu, Yingwei Pan, Guang Chen, Ting Yao, Changjun Jiang, Tao Mei
    Proceedings of the IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), 2023
  • Upcycling models under domain and category shift
    Sanqing Qu, Tianpei Zou, Florian Röhrbein, Cewu Lu, Guang Chen, Dacheng Tao, Changjun Jiang
    Proceedings of the IEEE/CVF conference on computer vision and pattern recognition, (CVPR), 2023
  • Screening model of candidate drugs for breast cancer based on ensemble learning algorithm and molecular descriptor
    Lihua Shi, Fan Yan, Haixin Liu
    Expert Systems with Applications, 2023
  • Bmd: A general class-balanced multicentric dynamic prototype strategy for source-free domain adaptation
    Sanqing Qu, Guang Chen, Jing Zhang, Zhijun Li, Wei He, Dacheng Tao
    European Conference on Computer Vision (ECCV), 2022
  • Molormer: a lightweight self-attention-based method focused on spatial structure of molecular graph for drug-drug interactions prediction
    Xudong Zhang, Gan Wang, Xiangyu Meng, Shuang Wang, Ying Zhang, Alfonso Rodriguez-Paton, Jianmin Wang, Xun Wang
    Briefings in Bioinformatics, 2022

比赛获奖

  • 第二届全球AI药物研发算法大赛
    冠军(1/226)
    2024年12月 北京 主办单位:清华大学药学院、百度飞桨、Intel
    Stretching Features and Labels: A Scalable Approach to OOD Molecular Property Prediction
    获奖团队:张旭东、瞿三清、卢凡、邹添培、陈广
  • 第六届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛
    国家银奖
    2020年11月
    青芯科技--中国高性能气湿徽传感器芯片突围者
    获奖团队:赵文镐等
  • 第七届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛
    国家铜奖
    2022年10月
    小型化、可在复杂环境部署、高灵敏度高安全性、高稳定性的氢气浓度传感器开发
    获奖团队:赵文镐等
  • 第九届中国国际“互联网+”创新创业大赛
    上海赛区银奖
    2023年9月
    速愈--AI赋能水凝胶用于难愈性伤口智能修复
    获奖团队:赵文镐等